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基因共表达网络数据分析软件V1.0
发布时间:2024-07-30     来源:本站    浏览次数:0

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成果简介

  本软件尚处于早期开发阶段,以 TCGA 数据库为数据主要来源,充分整合加权基因共表达网络分析,来挖掘疾病相关的重要基因集。

成果说明 

  加权基因共表达网络分析(Weighted correlation network analysis,WGCNA)是用来计算不同样本之间基因关联模式的系统生物学方法,可将表达模式相似的基因进行聚类,分析模块与特定疾病性状或表型之间的关联关系,用来鉴定高度协同变化的基因集, 并根据基因集的内连性和基因集与疾病表型之间的关联鉴定候选生物标记基因或治疗靶点,在研究疾病表型性状与基因关联分析等方面的研究中被广泛应用。 

  本软件充分整合加权基因共表达网络分析的各个环节,以 TCGA 数据库肿瘤基因表达数据为例,从原始基因表达数据格式获取及整理开始,通过一系列分析,形成一个基本的完整的加权基因共表达网络分析流程。分析软件分为三个模块,分别是软件下载及安装模块、WGCNA 分析模块,基因功能分析及可视化分析模块。其中软件下载和安装模块组在本地系统只需要运行一次即可。

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